2013年4月25日，中國佛教協會副會長、河北省佛教協會會長、湖北省佛教協會名譽會長、黃梅四祖寺方丈、五祖寺方丈、邢台大開元寺住持淨慧長老追思大會、荼毗法會在湖北黃梅四祖寺舉行。來自中央統戰部、國家宗教事務局、湖北省、河北省相關部門的領導，以及海內外的諸山長老、四眾弟子萬餘人參加追思大會，為淨慧長老送行。

國家宗教事務局副局長蔣堅永，中共中央統戰部二局副局長張天昱，國家宗教事務局一司司長劉威，中共湖北省委常委、統戰部部長張岱梨，湖北省人大常委會副主任周洪宇，湖北省人民政府副省長王君正，湖北省政協副主席鄭心穗，中共湖北省委統戰部副部長，省民宗委主任柳望春，湖北省政府副秘書長聶昌斌；中共河北省委統戰部副部長劉青，河北省民宗廳廳長陳會新，河北省政協副主席曹素華，河北省政協民宗委主任杜憲光，中共河北省委邢台市委常委、統戰部部長王素平；中共黃岡市委常委、統戰部部長劉海軍等黃岡市相關領導；淨慧長老家鄉代表、武漢市新洲區政協主席王建生，中共黃梅縣委書記餘建堂、縣長馬艷舟等相關部門領導出席追思大會。

中國佛教協會會長傳印長老，中國佛教協會諮議委員會副主席、江蘇省佛教協會名譽會長松純長老，中國佛教協會諮議委員會副主席、江蘇省佛教協會名譽會長無相長老，中國佛教協會副會長、雲南省佛教協會會長刀述仁，中國佛教協會副會長、四川省佛教協會會長永壽法師，中國佛教協會副會長、河南省佛教協會會長永信法師，中國佛教協會副會長、廣東省佛教協會會長明生法師，中國佛教協會副會長、江西省佛教協會會長純一法師，中國佛教協會副會長、湖北省佛教協會會長正慈法師，中國佛教協會副會長、海南省佛教協會會長印順法師，中國佛教協會秘書長王健，上海市佛教協會辦公室主任金易明教授等來自全國各地的佛教界人士出席追思大會；北京大學宗教研究所所長樓宇烈教授等專家學者代表出追思大會。

當天，各級領導、諸山長老、法師、淨慧長老弟子學子、護法居士、信眾等近萬人送別淨慧長老。

追思大會由中國佛教協會副會長、湖北省佛教協會會長正慈法師主持。首先全體肅立，為淨慧長老默哀一分鐘，向淨慧長老法相三鞠躬。

國宗局副局長蔣堅永宣讀中共中央政治局常委、全國政協主席俞正聲，中共中央政治局委員、國務院副總理劉延東，原中共中央政治局常委、全國政協主席賈慶林唁電。中共中央統戰部二局副局長張天昱宣讀全國政協副主席、中共中央統戰部部長令計劃唁電。湖北省人民政府副省長王君正宣讀湖北省委書記李鴻忠、省長王國生唁電。河北省政協副主席曹素華宣讀河北省委書記周本順、省長張慶偉唁電。

淨慧長老圓寂後，各級組織，各級領導、各界人士、廣大信眾都以不同方式表示深切哀悼，原中共中央政治局常委、全國政協主席李瑞環送來花圈，原中共中央政治局委員、全國人大副委員長王兆國表示慰問。

中共中央統戰部，國家宗教事務局，全國政協民宗委，中國佛教協會，中國道教協會或送來花圈，或發來唁電哀悼。中共中央統戰部常務副部長張裔炯、中央社會主義學院第一副院長葉小文、國家宗教事務局局長王作安送花圈悼念；中國佛教協會名譽會長一誠長老等各級黨政部門、領導和各佛協組織、領導及居士送花圈悼念淨慧長老；專家學者方立天教授、楊曾文教授、魏道儒教授、文懷沙教授送花圈悼念淨慧長老。

來自中國香港、中國台灣、澳大利亞、加拿大、美國、尼泊爾、匈牙利、日本、法國、德國等地的佛教團體、寺院也紛紛發來唁電，以各種方式對淨慧長老的圓寂表示深切的哀悼。

中國佛教協會副會長刀述仁介紹了淨慧長老生平。

追思大會上，中國佛教協會會長傳印長老表示，淨慧長老為禪宗的傳承弘揚、佛教事業的健康發展和佛教文化的傳播普及，貢獻了畢生心血。淨慧長老的圓寂是中國佛教事業的重大損失，希望廣大佛教界人士和信眾繼承淨慧長老遺願，學習長老的悲智願行，愛國愛教，發揚佛教優良傳統。

國宗局蔣堅永副局長在致辭中表示，淨慧長老是我國佛教愛國愛教的典範。長老一生堅持愛國愛教，擁護中國共產黨的領導，堅持走與社會主義社會相適應的道路，認真貫徹和宣傳宗教政策，行之所至，本著「利益一方，服務一方，和諧一方，教化一方」的宗旨，竭力促進社會和諧，是黨和政府肝膽相照的真誠朋友。淨慧長老的示寂是中國佛教事業的重大損失，希望廣大佛教界人士和信眾繼承淨慧長老遺願，在黨和政府的領導下，發揚佛教優良傳統，適應時代進步要求，莊嚴國土，利樂有情，不斷加強自身建設，精進不懈，進一步發揮在經濟社會發展中的積極作用，為全面建成小康社會，實現中華民族偉大復興的中國夢作貢獻。

追思大會最後由淨慧長老弟子明海法師致答謝詞。明海法師表示，將永遠傳承併發揚淨慧長老愛國愛教、弘法利生的精神，並代表治喪委員會工作班子對大家為淨慧長老喪事所做的一切辛勤努力表示感謝。

9時30分，四祖寺為淨慧長老舉行荼毗法會，中佛協會長傳印長老執拄杖說法並執舉火。松純長老、永壽法師、永信法師、明生法師、純一法師、正慈法師等一一拈香祈福，四祖寺僧眾以及四方佛子諸山長老、護法居士，各方善信虔誠念佛，告別淨慧長老。