(一)位於福建福清縣城西十七公里處。又稱南山。以盛產黃檗（其樹皮可作藥用與染料用）而得名。唐貞元五年（789），正幹禪師開山建寺，名般若堂。其後大辟堂宇，歷時八年，改稱建福寺。旋有希運禪師住山，黃檗之名頓顯，該寺遂成為我國禪宗臨濟派之大道場，宋時頗為興盛。其後，歷經興衰。明神宗曾賜以萬福禪寺之額。至崇禎十四年（1641），隱元始重興。後隱元東渡日本，開創宇治大和山，即取其規模，並取名為黃檗山萬福禪寺。［景德傳燈錄卷九、宋高僧傳卷二十、釋氏稽古略卷三、黃檗山誌］（參閱「萬福寺」5545）

(二)位於江西宜豐縣西五十七公里處。又稱鷲峰山。唐末，希運禪師至此開山。以其出家於福州黃檗山，故世稱此山為黃檗山，寺名黃檗寺，又稱靈鷲寺。不久，四方學者望風雲集，往來常有千餘人。唐宣宗曾幸此山，與希運同觀瀑布，並相對賦詩，從此黃檗宗風盛於江南。又希運之後，有法濟、志因、惟初、惟勝、道全、永泰等相繼住此，山名益著。南宋紹興九年（1139），高宗曾賜名「報恩光孝禪寺」，以為追念其父徽宗之所。至明中葉曾廢毀，然明思宗時，常愚、照通等曾復興之。［黃檗禪師傳心法要序、隆興佛教編年通論卷二十六、佛祖歷代通載卷二十三］

(三)位於江西餘幹東南四十六公里。又稱小廬山。

(四)為日本黃檗宗之大本山萬福寺之山號。（參閱「萬福寺」5545） p5374