位於日本奈良。平城京（奈良新京）於營造之際，許多寺院自舊址移建於此，其中獨允元興寺另建別院，本院與新院二寺併稱於世。

(一)亦稱本元興寺、安居院、飛鳥寺、法興寺。位於奈良縣高市郡明日香町飛鳥，為日本最早之寺院。建於崇峻天皇元年（588），寺內所存丈六釋迦像（飛鳥大佛）推測為鞍作止利所作，為日本初期雕刻史之代表作。全高二點七五公尺。然屢遭火災，破損不堪。此大伽藍至鎌倉以後未曾修復。

(二)新元興寺。位於奈良市。為日本南都七大寺之一。創建之初十分繁榮，仁和三年（887）遭火災後，未再重建，今僅存觀音堂（其內供奉平安初期之觀音、藥師木雕立像）、極樂院、十輪院（為本寺之分院）。［元興寺伽藍緣起、日本書紀、諸寺緣起集］ p1229